các người chơi chuyển từ nước ngọt hoặc thậm chí bể cá nước mặn lên bể của rạn san hô thường xuyên bối rối với việc không có những bộ lọc chạy điện lớn mà họ đã quen thuộc với các loại bể kia. Bể san hô đòi hỏi một mức độ khéo léo chứ không phải là sức mạnh khi nói đến lọc. Trong khi các thú chơi khác thường cố gắng để sở hữu nước trong vắt bằng việc Giải quyết những các hạt vật chất cùng với dựa vào thay nước để pha loãng ô nhiễm thì bể rạn san hô cố gắng có được nước sạch thông qua việc Xử lý tất cả những chất gây ô nhiễm tại một mức độ mà chỉ thay nước không thể làm được.Bộ lọc khô/ướt>>Tham khảo: Phụ kiện cá cảnh biển Bộ lọc khô/ướt là những bộ lọc lớn bằng acrylic hoặc kính, trở thành bể lọc cho bể cùng với bao gồm một khu vực tháp, trong đó trở về nước từ bể được chảy hoặc phun trên một vật liệu lọc bằng nhựa. Nguyên lý của bộ lọc này là là vi khuẩn hiếu khí (oxy) sẽ trú ngụ ở các vật liệu lọc cùng với chuyển đổi tất cả chất thải tạo ra của bể thành nitrat tương đối vô hại. Đây là “khô” phần của bộ lọc. Phần ‘Ướt’ thường gồm những một miếng bọt biển (bọt xốp) để lọc cơ học cùng với phần không gian để đặt than hoạt tính (activated carbon), sưởi và có thể cả một máy tách bọt (protein skimmer). Trong thực tế, bộ lọc khô/ướt tiến hành nhiệm vụ này, nhưng có những điểm xấu quan trọng. Bể có bộ lọc khô/ướt thường xuyên có vấn đề với việc nitrat vẫn tiếp tục tăng, chỉ sỡ hữu kết quả nitrat bằng không khi lấy bộ lọc khô/ướt ra. tại sao có thể như vậy là vấn đề chưa được hiểu rõ, nhưng nó là một hiện tượng luôn xẩy ra. Việc chuyển đổi chất thải thành nitrat được tiến hành có hiệu quả, nhưng bước cuối cùng để chuyển đổi tất cả khí vô hại là không thể cùng với vậy nên nitrat tích lũy trong hệ thống. Ngoài ra, phần lọc cơ học (bọt xốp) đôi khi được sử dụng trong tất cả bộ lọc khô/ướt là phản hiệu quả. BểSan hô là nơi cứ trus của vô số sinh vật có cuộc sống phụ thuộc vào lọc nước. Lọc cơ học là không cần thiết cùng với phản hiệu quả trong dài hạn.Máy tách bọt (protein skimmer) Bước đầu tiên trong làm sạch nước là Loại bỏ các chất ô nhiễm trước khi chúng đi vào chu trình nitơ. Lọc cơ học để Giải quyết những hạt vật chất có thể nhìn thấy trong nước có vẻ là cách có ích nhất để sở hữu điều này, nhưng không phải là như vậy. Phần lớn tất cả vật chất có thể nhìn thấy là những cục bụi vô hại trong khi các thứ có hại vô hình bị hòa tan trong nước. Đó là lý do cần máy tách bọt. Một máy tách bọt (protein skimmer) bao gồm một khoang phản ứng thông qua đó nước bể được trộn lẫn với tất cả bong bóng khí nhỏ. tất cả bong bóng này thu thập chất thải lên bề mặt của họ thông qua tất cả quá trình tự nhiên vì như thế bong bóng nổi lên trên trong khoang phản ứng. các bong bóng thu gom cùng với chuyển các chất thải lên phía trên cùng của khoang phản ứng. vì thế tất cả sản phẩm chất thải nổi lên trong khoang, bọt bẩn được tạo ra và cuối cùng được đẩy qua một ống dẫn vào bộ phận thu bọt bẩn. tất cả loại chất thải hữu cơ này chủ yếu là chất thải của cá cùng với máy tách bọt (protein skimmer) làm một việc có ích là Loại bỏ chúng trước khi chúng bước vào chu trình phân hủy sinh học. Chỉ khi trông thấy và ngửi thấy chất thải (skimmate) lấy ra từ tất cả máy tách bọt (protein skimmer) mới nhận ra khoảng nhiêu chất bẩn Loại bỏ khỏi nước.Lọc tận dụng tảoĐây là một kĩ thuật lọc được những người thích cách tiếp cận tự nhiên ủng hộ. Nguyên lý của phương pháp này là tảo sẽ tiêu thụ nitrate cùng với tất cả chất gây ô nhiễm nước khác khi chúng phát triển cùng với tiếp theo chúng được cắt tỉa thường xuyên sẽ loại các dưỡng chất ra bên ngoài của bể. Tảo dùng thường là một hoặc nhiều của loài Caulerpa, mặc dù bất kỳ tảo, bao gồm cả tảo tóc, sẽ tiến hành các chức năng tương tự. Trừ khi bể là loại bể kiểu đầm phá, tảo thường được nuôi bên ngoài bể trưng bầy chính hoặc trong tất cả bể lọc hoặc bể lọc phụ (Refugium) nếu có. Đơn giản chỉ cần thêm một đèn nhỏ phía trên các bể lọc cùng với ném vào một ít tảo Caulerpa bắt đầu được quá trình này.
